ホワイト ペーパー : SharePointのデータベース メンテナンス

ホワイト ペーパー : Microsoft® SharePoint® 製品とテクノロジのデータベース メンテナンス
http://technet.microsoft.com/ja-jp/library/cc262731.aspx

こちらは、SharePointにおけるSQL Serverの運用に必要な情報が記載されています。
SharePointは仕組み的にSQL Serverのテーブルとインデックスは断片化し易いと思われるので運用担当者は必ず一読した方が良いと思います。